]> Sergey Matveev's repositories - public-inbox.git/blobdiff - lib/PublicInbox/SearchIdx.pm
searchidx: increase term positions for all text terms
[public-inbox.git] / lib / PublicInbox / SearchIdx.pm
index 36f97b36d7bb8170237884bd27742cc6afed0fd1..6e44887d2651c2b20fef84e8a7d38369badf607e 100644 (file)
@@ -12,14 +12,17 @@ use warnings;
 use base qw(PublicInbox::Search PublicInbox::Lock);
 use PublicInbox::MIME;
 use PublicInbox::InboxWritable;
-use PublicInbox::MID qw/mid_clean id_compress mid_mime mids references/;
+use PublicInbox::MID qw/mid_clean id_compress mid_mime mids/;
 use PublicInbox::MsgIter;
 use Carp qw(croak);
 use POSIX qw(strftime);
+use PublicInbox::OverIdx;
+use PublicInbox::Spawn qw(spawn);
 require PublicInbox::Git;
+use Compress::Zlib qw(compress);
 
 use constant {
-       BATCH_BYTES => 1_000_000,
+       BATCH_BYTES => 10_000_000,
        DEBUG => !!$ENV{DEBUG},
 };
 
@@ -73,12 +76,13 @@ sub new {
        $ibx->umask_prepare;
        if ($version == 1) {
                $self->{lock_path} = "$mainrepo/ssoma.lock";
+               my $dir = $self->xdir;
+               $self->{over} = PublicInbox::OverIdx->new("$dir/over.sqlite3");
        } elsif ($version == 2) {
                defined $part or die "partition is required for v2\n";
-               # partition is a number or "all"
+               # partition is a number
                $self->{partition} = $part;
                $self->{lock_path} = undef;
-               $self->{msgmap_path} = "$mainrepo/msgmap.sqlite3";
        } else {
                die "unsupported inbox version=$version\n";
        }
@@ -114,27 +118,6 @@ sub add_val ($$$) {
        $doc->add_value($col, $num);
 }
 
-sub add_values ($$) {
-       my ($doc, $values) = @_;
-
-       my $ts = $values->[PublicInbox::Search::TS];
-       add_val($doc, PublicInbox::Search::TS, $ts);
-
-       my $num = $values->[PublicInbox::Search::NUM];
-       defined($num) and add_val($doc, PublicInbox::Search::NUM, $num);
-
-       my $bytes = $values->[PublicInbox::Search::BYTES];
-       defined($bytes) and add_val($doc, PublicInbox::Search::BYTES, $bytes);
-
-       my $lines = $values->[PublicInbox::Search::LINES];
-       add_val($doc, PublicInbox::Search::LINES, $lines);
-
-       my $ds = $values->[PublicInbox::Search::DS];
-       add_val($doc, PublicInbox::Search::DS, $ds);
-       my $yyyymmdd = strftime('%Y%m%d', gmtime($ds));
-       add_val($doc, PublicInbox::Search::YYYYMMDD, $yyyymmdd);
-}
-
 sub index_users ($$) {
        my ($tg, $smsg) = @_;
 
@@ -282,21 +265,21 @@ sub add_message {
        my ($self, $mime, $bytes, $num, $oid, $mid0) = @_;
        my $doc_id;
        my $mids = mids($mime->header_obj);
-       my $skel = $self->{skeleton};
-
+       $mid0 = $mids->[0] unless defined $mid0; # v1 compatibility
+       unless (defined $num) { # v1
+               $self->_msgmap_init;
+               $num = index_mm($self, $mime);
+       }
        eval {
                my $smsg = PublicInbox::SearchMsg->new($mime);
                my $doc = $smsg->{doc};
                my $subj = $smsg->subject;
-               my $xpath;
-               if ($subj ne '') {
-                       $xpath = $self->subject_path($subj);
-                       $xpath = id_compress($xpath);
-               }
-
-               my $lines = $mime->body_raw =~ tr!\n!\n!;
-               my @values = ($smsg->ds, $num, $bytes, $lines, $smsg->ts);
-               add_values($doc, \@values);
+               add_val($doc, PublicInbox::Search::TS(), $smsg->ts);
+               my @ds = gmtime($smsg->ds);
+               my $yyyymmdd = strftime('%Y%m%d', @ds);
+               add_val($doc, PublicInbox::Search::YYYYMMDD(), $yyyymmdd);
+               my $dt = strftime('%Y%m%d%H%M%S', @ds);
+               add_val($doc, PublicInbox::Search::DT(), $dt);
 
                my $tg = $self->term_generator;
 
@@ -312,6 +295,7 @@ sub add_message {
                        my $fn = $part->filename;
                        if (defined $fn && $fn ne '') {
                                $tg->index_text($fn, 1, 'XFN');
+                               $tg->increase_termpos;
                        }
 
                        return if $ct =~ m!\btext/x?html\b!i;
@@ -345,13 +329,13 @@ sub add_message {
                        index_body($tg, \@orig, $doc) if @orig;
                });
 
-               # populates smsg->references for smsg->to_doc_data
-               my $refs = parse_references($smsg);
-               $mid0 = $mids->[0] unless defined $mid0; # v1 compatibility
-               my $data = $smsg->to_doc_data($oid, $mid0);
                foreach my $mid (@$mids) {
                        $tg->index_text($mid, 1, 'XM');
+                       $tg->increase_termpos;
                }
+               $smsg->{to} = $smsg->{cc} = '';
+               PublicInbox::OverIdx::parse_references($smsg, $mid0, $mids);
+               my $data = $smsg->to_doc_data($oid, $mid0);
                $doc->set_data($data);
                if (my $altid = $self->{-altid}) {
                        foreach my $alt (@$altid) {
@@ -364,17 +348,11 @@ sub add_message {
                        }
                }
 
-               $self->delete_article($num) if defined $num; # for reindexing
-               if ($skel) {
-                       push @values, $mids, $xpath, $data;
-                       $skel->index_skeleton(\@values);
-                       $doc->add_boolean_term('Q' . $_) foreach @$mids;
-                       $doc->add_boolean_term('XNUM' . $num) if defined $num;
-                       $doc_id = $self->{xdb}->add_document($doc);
-               } else {
-                       $doc_id = link_and_save($self, $doc, $mids, $refs,
-                                               $num, $xpath);
+               if (my $over = $self->{over}) {
+                       $over->add_overview($mime, $bytes, $num, $oid, $mid0);
                }
+               $doc->add_boolean_term('Q' . $_) foreach @$mids;
+               $self->{xdb}->replace_document($doc_id = $num, $doc);
        };
 
        if ($@) {
@@ -411,11 +389,13 @@ sub remove_message {
        my $db = $self->{xdb};
        my $called;
        $mid = mid_clean($mid);
+       my $over = $self->{over};
 
        eval {
                batch_do($self, 'Q' . $mid, sub {
                        my ($ids) = @_;
                        $db->delete_document($_) for @$ids;
+                       $over->delete_articles($ids) if $over;
                        $called = 1;
                });
        };
@@ -426,21 +406,13 @@ sub remove_message {
        }
 }
 
-sub delete_article {
-       my ($self, $num) = @_;
-       my $ndel = 0;
-       batch_do($self, 'XNUM' . $num, sub {
-               my ($ids) = @_;
-               $ndel += scalar @$ids;
-               $self->{xdb}->delete_document($_) for @$ids;
-       });
-}
-
 # MID is a hint in V2
 sub remove_by_oid {
        my ($self, $oid, $mid) = @_;
        my $db = $self->{xdb};
 
+       $self->{over}->remove_oid($oid, $mid) if $self->{over};
+
        # XXX careful, we cannot use batch_do here since we conditionally
        # delete documents based on other factors, so we cannot call
        # find_doc_ids twice.
@@ -455,7 +427,9 @@ sub remove_by_oid {
                my $doc = $db->get_document($docid);
                my $smsg = PublicInbox::SearchMsg->wrap($doc, $mid);
                $smsg->load_expand;
-               push(@delete, $docid) if $smsg->{blob} eq $oid;
+               if ($smsg->{blob} eq $oid) {
+                       push(@delete, $docid);
+               }
        }
        $db->delete_document($_) foreach @delete;
        scalar(@delete);
@@ -473,105 +447,6 @@ sub term_generator { # write-only
        $self->{term_generator} = $tg;
 }
 
-# increments last_thread_id counter
-# returns a 64-bit integer represented as a decimal string
-sub next_thread_id {
-       my ($self) = @_;
-       my $db = $self->{xdb};
-       my $last_thread_id = int($db->get_metadata('last_thread_id') || 0);
-
-       $db->set_metadata('last_thread_id', ++$last_thread_id);
-
-       $last_thread_id;
-}
-
-sub parse_references ($) {
-       my ($smsg) = @_;
-       my $mime = $smsg->{mime};
-       my $hdr = $mime->header_obj;
-       my $refs = references($hdr);
-       return $refs if scalar(@$refs) == 0;
-
-       # prevent circular references via References here:
-       my %mids = map { $_ => 1 } @{mids($hdr)};
-       my @keep;
-       foreach my $ref (@$refs) {
-               if (length($ref) > PublicInbox::MID::MAX_MID_SIZE) {
-                       warn "References: <$ref> too long, ignoring\n";
-                       next;
-               }
-               next if $mids{$ref};
-               push @keep, $ref;
-       }
-       $smsg->{references} = '<'.join('> <', @keep).'>' if @keep;
-       \@keep;
-}
-
-sub link_doc {
-       my ($self, $doc, $refs, $old_tid) = @_;
-       my $tid;
-
-       if (@$refs) {
-               # first ref *should* be the thread root,
-               # but we can never trust clients to do the right thing
-               my $ref = shift @$refs;
-               $tid = resolve_mid_to_tid($self, $ref);
-               merge_threads($self, $tid, $old_tid) if defined $old_tid;
-
-               # the rest of the refs should point to this tid:
-               foreach $ref (@$refs) {
-                       my $ptid = resolve_mid_to_tid($self, $ref);
-                       merge_threads($self, $tid, $ptid);
-               }
-       } else {
-               $tid = defined $old_tid ? $old_tid : $self->next_thread_id;
-       }
-       $doc->add_boolean_term('G' . $tid);
-       $tid;
-}
-
-sub link_and_save {
-       my ($self, $doc, $mids, $refs, $num, $xpath) = @_;
-       my $db = $self->{xdb};
-       my $old_tid;
-       my $doc_id;
-       $doc->add_boolean_term('XNUM' . $num) if defined $num;
-       $doc->add_boolean_term('XPATH' . $xpath) if defined $xpath;
-       $doc->add_boolean_term('Q' . $_) foreach @$mids;
-
-       $self->{skel} and die "Should not have read-only skel here\n";;
-       foreach my $mid (@$mids) {
-               my $vivified = 0;
-               $self->each_smsg_by_mid($mid, sub {
-                       my ($cur) = @_;
-                       my $type = $cur->type;
-                       my $cur_tid = $cur->thread_id;
-                       $old_tid = $cur_tid unless defined $old_tid;
-                       if ($type eq 'mail') {
-                               # do not break existing mail messages,
-                               # just merge the threads
-                               merge_threads($self, $old_tid, $cur_tid);
-                               return 1;
-                       }
-                       if ($type ne 'ghost') {
-                               die "<$mid> has a bad type: $type\n";
-                       }
-                       my $tid = link_doc($self, $doc, $refs, $old_tid);
-                       $old_tid = $tid unless defined $old_tid;
-                       $doc_id = $cur->{doc_id};
-                       $self->{xdb}->replace_document($doc_id, $doc);
-                       ++$vivified;
-                       1;
-               });
-               $vivified > 1 and warn
-                       "BUG: vivified multiple ($vivified) ghosts for $mid\n";
-       }
-       # not really important, but we return any vivified ghost docid, here:
-       return $doc_id if defined $doc_id;
-       link_doc($self, $doc, $refs, $old_tid);
-       $self->{xdb}->add_document($doc);
-}
-
 sub index_git_blob_id {
        my ($doc, $pfx, $objid) = @_;
 
@@ -592,8 +467,28 @@ sub index_mm {
        my ($self, $mime) = @_;
        my $mid = mid_clean(mid_mime($mime));
        my $mm = $self->{mm};
-       my $num = $mm->mid_insert($mid);
-       return $num if defined $num;
+       my $num;
+
+       if (defined $self->{regen_down}) {
+               $num = $mm->num_for($mid) and return $num;
+
+               while (($num = $self->{regen_down}--) > 0) {
+                       if ($mm->mid_set($num, $mid) != 0) {
+                               return $num;
+                       }
+               }
+       } elsif (defined $self->{regen_up}) {
+               $num = $mm->num_for($mid) and return $num;
+
+               # this is to fixup old bugs due to add-remove-add
+               while (($num = ++$self->{regen_up})) {
+                       if ($mm->mid_set($num, $mid) != 0) {
+                               return $num;
+                       }
+               }
+       }
+
+       $num = $mm->mid_insert($mid) and return $num;
 
        # fallback to num_for since filters like RubyLang set the number
        $mm->num_for($mid);
@@ -604,18 +499,6 @@ sub unindex_mm {
        $self->{mm}->mid_delete(mid_clean(mid_mime($mime)));
 }
 
-sub index_mm2 {
-       my ($self, $mime, $bytes, $blob) = @_;
-       my $num = $self->{mm}->num_for(mid_clean(mid_mime($mime)));
-       add_message($self, $mime, $bytes, $num, $blob);
-}
-
-sub unindex_mm2 {
-       my ($self, $mime) = @_;
-       $self->{mm}->mid_delete(mid_clean(mid_mime($mime)));
-       unindex_blob($self, $mime);
-}
-
 sub index_both {
        my ($self, $mime, $bytes, $blob) = @_;
        my $num = index_mm($self, $mime);
@@ -649,12 +532,12 @@ sub batch_adjust ($$$$) {
        $$max -= $bytes;
        if ($$max <= 0) {
                $$max = BATCH_BYTES;
-               $batch_cb->($latest, 1);
+               $batch_cb->($latest);
        }
 }
 
 # only for v1
-sub rlog {
+sub read_log {
        my ($self, $log, $add_cb, $del_cb, $batch_cb) = @_;
        my $hex = '[a-f0-9]';
        my $h40 = $hex .'{40}';
@@ -665,53 +548,108 @@ sub rlog {
        my $bytes;
        my $max = BATCH_BYTES;
        local $/ = "\n";
+       my %D;
        my $line;
+       my $newest;
+       my $mid = '20170114215743.5igbjup6qpsh3jfg@genre.crustytoothpaste.net';
        while (defined($line = <$log>)) {
                if ($line =~ /$addmsg/o) {
                        my $blob = $1;
+                       delete $D{$blob} and next;
                        my $mime = do_cat_mail($git, $blob, \$bytes) or next;
+                       my $mids = mids($mime->header_obj);
+                       foreach (@$mids) {
+                               warn "ADD $mid\n" if ($_ eq $mid);
+                       }
                        batch_adjust(\$max, $bytes, $batch_cb, $latest);
                        $add_cb->($self, $mime, $bytes, $blob);
                } elsif ($line =~ /$delmsg/o) {
                        my $blob = $1;
-                       my $mime = do_cat_mail($git, $blob, \$bytes) or next;
-                       batch_adjust(\$max, $bytes, $batch_cb, $latest);
-                       $del_cb->($self, $mime);
+                       $D{$blob} = 1;
                } elsif ($line =~ /^commit ($h40)/o) {
                        $latest = $1;
+                       $newest ||= $latest;
                }
        }
-       $batch_cb->($latest, 0);
+       # get the leftovers
+       foreach my $blob (keys %D) {
+               my $mime = do_cat_mail($git, $blob, \$bytes) or next;
+               my $mids = mids($mime->header_obj);
+               foreach (@$mids) {
+                       warn "DEL $mid\n" if ($_ eq $mid);
+               }
+               $del_cb->($self, $mime);
+       }
+       $batch_cb->($latest, $newest);
 }
 
 sub _msgmap_init {
        my ($self) = @_;
+       die "BUG: _msgmap_init is only for v1\n" if $self->{version} != 1;
        $self->{mm} ||= eval {
                require PublicInbox::Msgmap;
-               my $msgmap_path = $self->{msgmap_path};
-               if (defined $msgmap_path) { # v2
-                       PublicInbox::Msgmap->new_file($msgmap_path, 1);
-               } else {
-                       PublicInbox::Msgmap->new($self->{mainrepo}, 1);
-               }
+               PublicInbox::Msgmap->new($self->{mainrepo}, 1);
        };
 }
 
 sub _git_log {
        my ($self, $range) = @_;
-       $self->{git}->popen(qw/log --reverse --no-notes --no-color
+       my $git = $self->{git};
+
+       if (index($range, '..') < 0) {
+               my $regen_max = 0;
+               # can't use 'rev-list --count' if we use --diff-filter
+               my $fh = $git->popen(qw(log --pretty=tformat:%h
+                               --no-notes --no-color --no-renames
+                               --diff-filter=AM), $range);
+               ++$regen_max while <$fh>;
+               my (undef, $max) = $self->{mm}->minmax;
+
+               if ($max && $max == $regen_max) {
+                       # fix up old bugs in full indexes which caused messages to
+                       # not appear in Msgmap
+                       $self->{regen_up} = $max;
+               } else {
+                       # normal regen is for for fresh data
+                       $self->{regen_down} = $regen_max;
+               }
+       }
+
+       $git->popen(qw/log --no-notes --no-color --no-renames
                                --raw -r --no-abbrev/, $range);
 }
 
-# indexes all unindexed messages
+sub is_ancestor ($$$) {
+       my ($git, $cur, $tip) = @_;
+       return 0 unless $git->check($cur);
+       my $cmd = [ 'git', "--git-dir=$git->{git_dir}",
+               qw(merge-base --is-ancestor), $cur, $tip ];
+       my $pid = spawn($cmd);
+       defined $pid or die "spawning ".join(' ', @$cmd)." failed: $!";
+       waitpid($pid, 0) == $pid or die join(' ', @$cmd) .' did not finish';
+       $? == 0;
+}
+
+sub need_update ($$$) {
+       my ($self, $cur, $new) = @_;
+       my $git = $self->{git};
+       return 1 if $cur && !is_ancestor($git, $cur, $new);
+       my $range = $cur eq '' ? $new : "$cur..$new";
+       chomp(my $n = $git->qx(qw(rev-list --count), $range));
+       ($n eq '' || $n > 0);
+}
+
+# indexes all unindexed messages (v1 only)
 sub _index_sync {
        my ($self, $opts) = @_;
        my $tip = $opts->{ref} || 'HEAD';
        my $reindex = $opts->{reindex};
        my ($mkey, $last_commit, $lx, $xlog);
-       $self->{git}->batch_prepare;
-       my $xdb = _xdb_acquire($self);
-       $xdb->begin_transaction;
+       my $git = $self->{git};
+       $git->batch_prepare;
+
+       my $xdb = $self->begin_txn_lazy;
+       my $mm = _msgmap_init($self);
        do {
                $xlog = undef;
                $mkey = 'last_commit';
@@ -721,122 +659,54 @@ sub _index_sync {
                        $lx = '';
                        $mkey = undef if $last_commit ne '';
                }
+
+               # use last_commit from msgmap if it is older or unset
+               my $lm = $mm->last_commit || '';
+               if (!$lm || ($lm && $lx && is_ancestor($git, $lm, $lx))) {
+                       $lx = $lm;
+               }
+
+               $self->{over}->rollback_lazy;
+               $self->{over}->disconnect;
+               delete $self->{txn};
                $xdb->cancel_transaction;
                $xdb = _xdb_release($self);
 
-               # ensure we leak no FDs to "git log"
+               # ensure we leak no FDs to "git log" with Xapian <= 1.2
                my $range = $lx eq '' ? $tip : "$lx..$tip";
                $xlog = _git_log($self, $range);
 
-               $xdb = _xdb_acquire($self);
-               $xdb->begin_transaction;
+               $xdb = $self->begin_txn_lazy;
        } while ($xdb->get_metadata('last_commit') ne $last_commit);
 
-       my $mm = _msgmap_init($self);
        my $dbh = $mm->{dbh} if $mm;
-       my $mm_only;
        my $cb = sub {
-               my ($commit, $more) = @_;
+               my ($commit, $newest) = @_;
                if ($dbh) {
-                       $mm->last_commit($commit) if $commit;
+                       if ($newest) {
+                               my $cur = $mm->last_commit || '';
+                               if (need_update($self, $cur, $newest)) {
+                                       $mm->last_commit($newest);
+                               }
+                       }
                        $dbh->commit;
                }
-               if (!$mm_only) {
-                       $xdb->set_metadata($mkey, $commit) if $mkey && $commit;
-                       $xdb->commit_transaction;
-                       $xdb = _xdb_release($self);
+               if ($mkey && $newest) {
+                       my $cur = $xdb->get_metadata($mkey);
+                       if (need_update($self, $cur, $newest)) {
+                               $xdb->set_metadata($mkey, $newest);
+                       }
                }
+               $self->commit_txn_lazy;
                # let another process do some work... <
-               if ($more) {
-                       if (!$mm_only) {
-                               $xdb = _xdb_acquire($self);
-                               $xdb->begin_transaction;
-                       }
+               if (!$newest) {
+                       $xdb = $self->begin_txn_lazy;
                        $dbh->begin_work if $dbh;
                }
        };
 
-       if ($mm) {
-               $dbh->begin_work;
-               my $lm = $mm->last_commit || '';
-               if ($lm eq $lx) {
-                       # Common case is the indexes are synced,
-                       # we only need to run git-log once:
-                       rlog($self, $xlog, *index_both, *unindex_both, $cb);
-               } else {
-                       # Uncommon case, msgmap and xapian are out-of-sync
-                       # do not care for performance (but git is fast :>)
-                       # This happens if we have to reindex Xapian since
-                       # msgmap is a frozen format and our Xapian format
-                       # is evolving.
-                       my $r = $lm eq '' ? $tip : "$lm..$tip";
-
-                       # first, ensure msgmap is up-to-date:
-                       my $mkey_prev = $mkey;
-                       $mkey = undef; # ignore xapian, for now
-                       my $mlog = _git_log($self, $r);
-                       $mm_only = 1;
-                       rlog($self, $mlog, *index_mm, *unindex_mm, $cb);
-                       $mm_only = $mlog = undef;
-
-                       # now deal with Xapian
-                       $mkey = $mkey_prev;
-                       $dbh = undef;
-                       rlog($self, $xlog, *index_mm2, *unindex_mm2, $cb);
-               }
-       } else {
-               # user didn't install DBD::SQLite and DBI
-               rlog($self, $xlog, *add_message, *unindex_blob, $cb);
-       }
-}
-
-# this will create a ghost as necessary
-sub resolve_mid_to_tid {
-       my ($self, $mid) = @_;
-       my $tid;
-       $self->each_smsg_by_mid($mid, sub {
-               my ($smsg) = @_;
-               my $cur_tid = $smsg->thread_id;
-               if (defined $tid) {
-                       merge_threads($self, $tid, $cur_tid);
-               } else {
-                       $tid = $smsg->thread_id;
-               }
-               1;
-       });
-       return $tid if defined $tid;
-
-       $self->create_ghost($mid)->thread_id;
-}
-
-sub create_ghost {
-       my ($self, $mid) = @_;
-
-       my $tid = $self->next_thread_id;
-       my $doc = Search::Xapian::Document->new;
-       $doc->add_boolean_term('Q' . $mid);
-       $doc->add_boolean_term('G' . $tid);
-       $doc->add_boolean_term('T' . 'ghost');
-
-       my $smsg = PublicInbox::SearchMsg->wrap($doc, $mid);
-       $self->{xdb}->add_document($doc);
-
-       $smsg;
-}
-
-sub merge_threads {
-       my ($self, $winner_tid, $loser_tid) = @_;
-       return if $winner_tid == $loser_tid;
-       my $db = $self->{xdb};
-       batch_do($self, 'G' . $loser_tid, sub {
-               my ($ids) = @_;
-               foreach my $docid (@$ids) {
-                       my $doc = $db->get_document($docid);
-                       $doc->remove_term('G' . $loser_tid);
-                       $doc->add_boolean_term('G' . $winner_tid);
-                       $db->replace_document($docid, $doc);
-               }
-       });
+       $dbh->begin_work;
+       read_log($self, $xlog, *index_both, *unindex_both, $cb);
 }
 
 sub DESTROY {
@@ -845,16 +715,13 @@ sub DESTROY {
        $_[0]->{lockfh} = undef;
 }
 
-# remote_* subs are only used by SearchIdxPart and SearchIdxSkeleton
+# remote_* subs are only used by SearchIdxPart
 sub remote_commit {
        my ($self) = @_;
        if (my $w = $self->{w}) {
                print $w "commit\n" or die "failed to write commit: $!";
        } else {
                $self->commit_txn_lazy;
-               if (my $skel = $self->{skeleton}) {
-                       $skel->commit_txn_lazy;
-               }
        }
 }
 
@@ -875,7 +742,7 @@ sub remote_close {
 sub remote_remove {
        my ($self, $oid, $mid) = @_;
        if (my $w = $self->{w}) {
-               # triggers remove_by_oid in partition or skeleton
+               # triggers remove_by_oid in a partition
                print $w "D $oid $mid\n" or die "failed to write remove $!";
        } else {
                $self->begin_txn_lazy;
@@ -887,14 +754,17 @@ sub begin_txn_lazy {
        my ($self) = @_;
        return if $self->{txn};
        my $xdb = $self->{xdb} || $self->_xdb_acquire;
+       $self->{over}->begin_lazy if $self->{over};
        $xdb->begin_transaction;
        $self->{txn} = 1;
+       $xdb;
 }
 
 sub commit_txn_lazy {
        my ($self) = @_;
        delete $self->{txn} or return;
        $self->{xdb}->commit_transaction;
+       $self->{over}->commit_lazy if $self->{over};
 }
 
 sub worker_done {